ישנם שישה עקרונות מנחים בתרגול על-פי השיטה:
- ריכוז– ריכוז הוא המפתח לחיבור בין המחשבה לבין הפעלת הגוף. על פי פילאטיס, יש להתרכז בכל תנועה שאנו עושים ולהרגיש את העבודה של כל שריר ושריר בזמן התרגול.
- שליטה– מטרת העל בשיטה היא להגיע לשליטה מלאה על הגוף. השליטה על כל תנועה ותנועה מושגת ע"י התרכזות מעמיקה בביצוע התנועה.
- מרכז גוף– מכונה "power house" והיציבות והחוזק שלו מהווה את הבסיס לתנועה יעילה של הגפיים העליונות והתחתונות. התנועות כולן מתחילות ממרכז הגוף, שם נמצאת האנרגיה.
- תנועה זורמת– התנועות זורמות החוצה מתוך מרכז גוף חזק. התנועות אינן סטטיות או קופצניות, הן מבוצעות בשטף ובחן.
- דיוק– הדיוק בתנועה הכרחי ליצירת השליטה ולכן מושם עליו דגש רב. תנועות מדויקות ונשלטות יוצרות הרמוניה וחינניות בתנועותינו ומונעות בזבוז מיותר של אנרגיה.
- נשימה– נשימה נכונה מהווה את הבסיס להשגת תנועה איכותית ונשלטת. הנשימות מבוצעות בשילוב עם התנועות.